Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SYNPO2Q9UMS6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms