Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IGSF9Q9P2J2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IGSF9Q9P2J2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms