Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SLC6A20Q9NP91 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SLC6A20Q9NP91 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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