Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms