Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
POLR2J2Q9GZM3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
POLR2J2Q9GZM3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms