Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCGF6Q9BYE7 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms