Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRTQ9BXP5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms