Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TMEM175Q9BSA9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms