Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LPIN3Q9BQK8 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LPIN3Q9BQK8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms