Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 KCNAB1-215ENST00000618897 4437 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 POC1B-GALNT4-202ENST00000548729 5436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PMCHL2Q9BQD1 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms