Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SUSD3Q96L08 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD3Q96L08 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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