Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113Q902F9 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms