Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
APOBEC4Q8WW27 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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