Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARRDC4Q8NCT1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms