Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TPTE2Q6XPS3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TPTE2Q6XPS3 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms