Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LMBR1LQ6UX01 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms