Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 LITAF-203ENST00000413364 2292 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC01545Q5VT33 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms