Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms