Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CCDC96Q2M329 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CCDC96Q2M329 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC96Q2M329 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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