Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF239Q16600 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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