Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS72Q15906 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VPS72Q15906 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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