Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
TLR1Q15399 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms