Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SHPRHQ149N8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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