Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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GBX1Q14549 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
GBX1Q14549 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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