Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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APOFQ13790 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
APOFQ13790 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
APOFQ13790 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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