Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATP1A4Q13733 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATP1A4Q13733 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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