Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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