Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMS2P11Q13670 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 ARHGAP45-210ENST00000590214 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PMS2P11Q13670 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms