Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHAF1AQ13111 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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