Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
FOXF2Q12947 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms