Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FOXF1Q12946 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FOXF1Q12946 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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