Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC099786.2-201ENST00000427892 2203 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL592528.1-201ENST00000380008 3466 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 HIRIP3-201ENST00000279392 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CFAP43-204ENST00000369720 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DQX1-201ENST00000393951 2540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CD300CQ08708 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms