Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CALD1Q05682 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms