Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms