Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CNTN2Q02246 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms