Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
E2F1Q01094 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2F1Q01094 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms