Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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FAM3AP98173 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FAM3AP98173 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
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