Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBASH3AP57075 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms