Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AP3M2P53677 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms