Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
PGGT1BP53609 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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PGGT1BP53609 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
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PGGT1BP53609 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PGGT1BP53609 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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