Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PSEN2P49810 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSEN2P49810 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms