Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GJA8P48165 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GJA8P48165 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GJA8P48165 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms