Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RECQLP46063 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RECQLP46063 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms