Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LRPPRCP42704 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LRPPRCP42704 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms