Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GJC1P36383 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJC1P36383 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms