Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTNNA1P35221 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms