Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP2P32456 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GBP2P32456 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms