Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASQ1P31415 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms