Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ALMS1P1-201ENST00000428767 921 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC116631.1-201ENST00000640685 576 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NR0B1-201ENST00000378963 475 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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PTPRMP28827 TRBV11-2-201ENST00000471935 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRMP28827 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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PTPRMP28827 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTPRMP28827 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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