Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PSMA5P28066 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA5P28066 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms